Tu as surement trouvé la solution mais au cas où, et si j'ai bien compris:
Chaque install portable et standard a ses propres dossiers et fichiers config (c'est l'intérêt), et son propre exécutable reaper. Il faut donc créer des raccourcis identifiables pour chaque install ("reaper test" par exemple). C'est ce que je fais pour mes bidouilles, pour éviter d'aller chercher à la main dans le bon dossier. Le "show reaper ressource path" montre le chemin de l'exécutable utilisé.
Si tu as importé ta config standard dans ta config portable tu as récupéré les variables de chemin vst ou autres. Tu peux les partager ou non selon ton intention.
J'utilise Windows et j'ignore s'il y a des différence sur ce point avec Mac OS.
Si tu as déjà réglé ton problème ça pourra toujours servir à d'autres