Ciao Buz,
come dici tu, quando si registra midi in simultanea con un VSTi, l' effetto della latenza si riflette sulla posizione generale delle note (di solito un po in anticipo) e, nel tuo caso, escludendo errori nell' esecuzione, ti consiglio di selezionarle tutte (quadratini, rombi etc..) e posizionarle di nuovo in griglia con un gesto solo.
Poi potrai rifinire il tutto a mano o con la quantizzazione.
Per il rendering stai tranquillo.